La historia trata sobre Aono Tsukune, un chico que ha suspendido su examen de acceso al instituto medio, y cuando estaba a punto de resignarse, su padre encontró un sobre con los papeles para ingresar en la Academia Yōkai, un instituto construido en un remoto lugar apartado de la civilización, que curiosamente resulta ser una escuela para jóvenes monstruos que aprenderán a "coexistir" con los humanos. Durante el camino hacia el instituto tiene un percance con una chica preciosa de nombre Moka, la cual le revela su verdadera identidad, que es una vampira, al principio Tsukune no lo podia creer e intenta huir de la escuela, pero cuando Moka se encuentra en peligro este va a ayudarla(aunque no es mucha la ayuda, ya que al final ella es quien lo salva), pero desde ese momento Tsukune decide quedarse en esa escuela ya que ya ha hecho una amiga, y asi siguen las historias de Tsukune y Moka en la Academia Yōkai, donde apareceran nuevos personajes, romances, accion pero sin duda mucha diversion